MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides J18 plasmid pKLE04

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016828	GTT	2	6	16	21	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016828	CCA	2	6	29	34	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016828	TGC	2	6	76	81	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016828	CCA	2	6	101	106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_016828	ACT	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016828	CAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016828	TTA	2	6	165	170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016828	GTC	2	6	171	176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016828	CTT	2	6	218	223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016828	AAT	2	6	231	236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016828	TA	3	6	247	252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016828	TTA	2	6	290	295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016828	A	6	6	349	354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016828	CTT	2	6	355	360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016828	TAA	2	6	1363	1368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016828	TTC	2	6	2088	2093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016828	TTG	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016828	TGAAAT	2	12	2138	2149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016828	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016828	TAA	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016828	GTT	2	6	8630	8635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016828	TAT	2	6	8683	8688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016828	A	6	6	8714	8719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016828	T	6	6	8736	8741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016828	T	6	6	8758	8763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016828	T	6	6	8780	8785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016828	TTA	2	6	8813	8818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016828	A	7	7	8842	8848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016828	TTA	2	6	8891	8896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016828	A	12	12	8904	8915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016828	AT	3	6	8978	8983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016828	TTA	2	6	8987	8992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016828	ATT	2	6	8999	9004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016828	TAA	2	6	9011	9016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016828	ATT	2	6	9047	9052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016828	CCT	2	6	10349	10354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016828	ACT	2	6	10496	10501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016828	TAT	2	6	10515	10520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016828	CGG	2	6	10538	10543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016828	A	6	6	10650	10655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016828	TATC	2	8	10675	10682	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016828	T	7	7	10762	10768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016828	TAA	2	6	10780	10785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016828	TCC	2	6	11307	11312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016828	AAC	2	6	11337	11342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016828	TAC	2	6	11353	11358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016828	GAT	2	6	11384	11389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016828	CTA	2	6	11404	11409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016828	A	6	6	11409	11414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016828	ATT	2	6	14161	14166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016828	A	6	6	14167	14172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016828	TA	3	6	15230	15235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016828	TAATT	2	10	15238	15247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016828	TTC	2	6	15272	15277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016828	AAT	2	6	15288	15293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016828	ATTT	2	8	15300	15307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016828	AATTT	2	10	15313	15322	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016828	A	7	7	15328	15334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016828	AT	3	6	15354	15359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016828	GA	3	6	15386	15391	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016828	TAG	2	6	15401	15406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016828	GA	3	6	15415	15420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016828	T	7	7	15482	15488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016828	TA	3	6	15548	15553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016828	ATGG	2	8	15963	15970	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016828	TAA	2	6	16001	16006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016828	T	6	6	16094	16099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016828	CTT	2	6	16209	16214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016828	TAT	2	6	16223	16228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016828	A	7	7	16239	16245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016828	CTA	2	6	16259	16264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016828	CT	3	6	18487	18492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016828	ACC	2	6	18559	18564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_016828	TTG	2	6	18636	18641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016828	GTTA	2	8	18655	18662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016828	ATT	2	6	18694	18699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016828	ATC	2	6	18763	18768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016828	TCA	2	6	18812	18817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016828	ATCT	2	8	18853	18860	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016828	CGA	2	6	18914	18919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016828	CAC	2	6	18981	18986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016828	AAAG	2	8	19015	19022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016828	TTC	2	6	19069	19074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016828	ATT	2	6	19096	19101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016828	AAT	2	6	19114	19119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016828	CTA	2	6	19131	19136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016828	ATC	2	6	19174	19179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016828	TTG	2	6	19272	19277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.